Kota ini terbagi menjadi beberapa kawasan yang dihuni oleh klan-klan (Bani) berbeda dari suku Quraisy. Letak rumah-rumah ini menjadi penanda penting yang berkaitan dengan para tokoh kunci dalam sejarah Islam :

- Kawasan Bani Hasyim: Tempat di mana Rasulullah ﷺ dan pamannya, Abu Thalib, tinggal.
- Kawasan Bani Taym: Kawasan tempat Abu Bakar Ash-Shiddiq, sahabat terdekat Nabi, tinggal.
- Kawasan Bani Adi: Kawasan tempat Umar bin Khattab tinggal, sebelum dan sesudah masuk Islam.
- Kawasan Bani Makhzum: Kawasan tempat Khalid bin Walid dan Abu Jahal tinggal.
- Kawasan Bani Umayyah: Kawasan tempat Usman bin Affan dan Abu Sufyan tinggal.
- Kawasan Rumah Khadijah: Terletak tepat di bawah bukit Marwah .
Batas Kota dan Wilayah Sekitar
Makkah saat itu juga memiliki batas-batas yang ditandai dengan jalan-jalan keluar menuju wilayah penting . Di utara, terdapat jalan menuju Mina, Arafah, dan Thaif. Di selatan, jalan menuju Yaman. Sementara di barat, jalan menuju Laut Merah dan kota pelabuhan Jeddah (yang saat itu masih berupa pemukiman kecil). Di luar kawasan pemukiman, terdapat gua-gua bersejarah seperti Gua Hira di jabal Nur tempat beliau menerima wahyu pertama, dan Gua Tsur di selatan kota tempat beliau bersembunyi saat hijrah .